据丛书主编、侵华日军第七三一部队罪证陈列馆馆长金成民介绍，这套丛书资料收集工作历时30余年，编撰整理工作历时2年，收录了珍贵文献档案2万余页，文字量近千万字，全面深刻地揭露了七三一部队细菌战和人体实验的犯罪。

根据内容可将本丛书分为两部分：其一为学术研究，收录了当前国内外对日本细菌战和人体实验问题研究的学术成果，如《日本细菌战》、《七三一问题国际研究中心文集》、《七三一部队旧址调查与研究》、《侵华日军细菌战受害者名录》、《战争与医学》、《解密日本细菌战历史：军医中将石井四郎的故事》等；其二为文献资料，大部分据史料原件影印整理出版，如《七三一部队炭疽菌实验A报告》、《七三一部队鼻疽菌实验G报告》、《七三一部队鼠疫菌实验Q报告》、《美军调查日本细菌战总结报告书》、《七三一部队见证人口述史料集》、《日本细菌战部队命令?文件集》、《关东军?华中军?南方军防疫研究报告》、《“北支那”防疫给水部档案》、《师团防疫给水部档案》、《日本细菌战史料集：细菌实验类》等。

全书收录了大量日本关东军、华中军、南方军，以及“北支那”防疫给水部、各师团防疫给水部档案，并系统整理了日军进行人体实验的证据资料，包括细菌实验类、预防免疫类、流行病与传染病类等，以史料为据，以文献为证，记录了侵华日军进行细菌战和人体实验的暴行。本次整理出版了大量弥足珍贵的历史文献，编者将丛书部分文献译成中文，并在文献分集前撰写了《导语》，对其内容做简要介绍、编辑说明和总体评价。

收录本丛书的部分文献是首次在中国公开出版，如《日本细菌战部队命令?文件集》中收录的大量日军参谋本部、陆军省、关东军的命令文件，这些文件涉及到日本政府、军队、医疗机构等各个方面；《七三一部队见证人口述史料集》和《日本细菌战档案选编》收录了加害者、受害者和见证人三方面的证言，并结合了中国、美国和日本三方的历史档案，使其内容更具客观性和真实性。本套丛书以美国、日本保存的细菌战、人体实验相关档案为主，结合中国学者多年来的调查寻访取证，辅以长期收集整理研究的受害者名录、旧址调查报告、研究文集、日本细菌战史料档案等成果，这些档案和研究成果多数都是首次公开的新资料、新证据和新发现。

本丛书使用的大量历史档案和口述史料，以及中日美三国学者最新的学术研究成果，全面揭露了日本细菌战部队反人类、反文明和反伦理的本质，集中反映了日本细菌战和人体实验是自上而下、有组织、有预谋的集团犯罪，深刻揭示了七三一部队的战时犯罪、战争责任和战后贻害。